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> そもそも、遺伝子情報をバージョン管理する意義はあるのだろうか?
真面目に答えますと,アノテーションデータがアップデートされれば情報の更新はありえます.今回公開されたデータはDNA配列全体ではなくて,個人の特徴を示すSNP 100万箇所のデータです.それらは既に報告されている,「ヒト間で違いのある場所」で,これを元に病気に罹患しやすいかどうかを判定することも(理論的には)できますが,元の参照情報の方がアップデートされれば,ゲノム上の位置が違ったり別のものとされていたものが同じものに統合されたり,本当はヒトの配列でなかったりといったこともないわけではありません.
また,今回の情報の有用性ですが,通常ゲノム情報は個人から取得するにはいろいろと情報管理で厳しい制限もありますし,学生が簡単に自分のデータを読めるほどには安価でないということから,自由かつ無料で使えるので,学生の学習用にはよいのではないかと思いました.データ構造,ファイルフォーマット,データの規模や規則性が本番そのものなので,現実のヒトの情報に合わせたランダムデータをつくるよりよほど効率的になります.
#Manu Sporny氏がこの先病気になったときにその情報も公開してもらえば更に便利に.
自分にがんが見つかったら、毎日組織サンプルを取って、それぞれ全ゲノムをシーケンシングして、変異箇所をトレースできるようにするとか…
…してくれたら尊敬するなぁ。
#お金はすっごいかかるけど。
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犯人はmoriwaka -- Anonymous Coward
マジレス (スコア:1)
> そもそも、遺伝子情報をバージョン管理する意義はあるのだろうか?
真面目に答えますと,アノテーションデータがアップデートされれば情報の更新はありえます.
今回公開されたデータはDNA配列全体ではなくて,個人の特徴を示すSNP 100万箇所のデータです.
それらは既に報告されている,「ヒト間で違いのある場所」で,これを元に病気に罹患しやすいかどうかを判定する
ことも(理論的には)できますが,元の参照情報の方がアップデートされれば,ゲノム上の位置が違ったり
別のものとされていたものが同じものに統合されたり,本当はヒトの配列でなかったりといったことも
ないわけではありません.
また,今回の情報の有用性ですが,通常ゲノム情報は個人から取得するにはいろいろと情報管理で
厳しい制限もありますし,学生が簡単に自分のデータを読めるほどには安価でないということから,
自由かつ無料で使えるので,学生の学習用にはよいのではないかと思いました.
データ構造,ファイルフォーマット,データの規模や規則性が本番そのものなので,現実のヒトの
情報に合わせたランダムデータをつくるよりよほど効率的になります.
#Manu Sporny氏がこの先病気になったときにその情報も公開してもらえば更に便利に.
kaho
Re:マジレス (スコア:1)
自分にがんが見つかったら、毎日組織サンプルを取って、それぞれ全ゲノムをシーケンシングして、変異箇所をトレースできるようにするとか…
…してくれたら尊敬するなぁ。
#お金はすっごいかかるけど。