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サイエンス

安価なDNA検査サービスに犬のDNAを送ってみた結果 43

ストーリー by hylom
DNA全体のチェックはしていないのだろう 部門より

一時日本でも話題になった民間によるDNA診断サービスに犬のDNAを送ってみたところ、興味深い結果が帰ってきたという(INTERNET Watch)。

NBC Chicagoに掲載されたとあるリポーターの記事によると、ORIG3N社の「SUPERHERO」という遺伝子検査キットを使ってメスのラブラドール・レトリバーの遺伝子を採取してDNA診断を申し込んだところ、このDNAが犬のものであることは見抜けず、「筋力が優れておりボクシングやバスケットボールのような瞬発力が必要な競技に向いており、また自転車やランニングのような耐久力が必要な競技に向いた心肺能力もある」という診断結果が帰ってきたという。

記事では、現時点では遺伝子診断にはまだ多くの課題があり、多くの遺伝子診断サービスは不確実な結果を返す可能性があることや、こういったサービスは実用的ではないだけでなくときには有害な結果を返すこともある、という専門家のコメントも掲載されている。

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  • だいたい合ってる (スコア:4, おもしろおかしい)

    by Anonymous Coward on 2018年05月09日 16時29分 (#3405302)
    >瞬発力のある筋肉と心拍力を兼ね備えて
    知能が高いですとか判定されたんならおかしいねってなるけど
    これなら結果そのものはまあ納得行くんじゃないの?
    商品ページでも種を判定しますとは書いてないみたいだし
    • by kazuhix (21600) on 2018年05月09日 23時33分 (#3405512) 日記

      いや、耐久力って、ヒトが最強じゃなかったっけ?

      --
      ヽ( )`ω´( )ノ
      親コメント
      • by Anonymous Coward
        人間は確かに持久力が高いが、追跡型の狩りをするオオカミの子孫であるイヌもそれに匹敵する
        というか、だからこそ人間は他の動物ではなくあえてオオカミを家畜化してイヌを創りだしたわけ
        ただしオオカミは寒冷地の生き物だから人間の原産地である熱帯に連れて行かれると不利
    • by Anonymous Coward on 2018年05月09日 16時36分 (#3405306)

      なんか複数の業者に出すと、みんなバラバラの結果になるとか聞いた。
      ほんと信頼できるのかどうか・・・
      占いと一緒で、誰にでも当てはまりそうなことを文章にして送り返すだけで客は喜んでくれるのかも。

      親コメント
      • Re:だいたい合ってる (スコア:2, すばらしい洞察)

        by Anonymous Coward on 2018年05月09日 18時19分 (#3405368)

        >なんか複数の業者に出すと、みんなバラバラの結果になるとか聞いた。

        同じ業者に同じDNAを複数回出して、結果全部同じになるか
        誰か試してくれよー

        親コメント
        • by Anonymous Coward

          まずは消費者庁がこれを全業者にやるべきですね

      • by nemui4 (20313) on 2018年05月09日 16時39分 (#3405310) 日記

        >なんか複数の業者に出すと、みんなバラバラの結果になるとか聞いた。

        料金お高めでも信頼できるところとか無いんすかね。
        #○○御用達の検査機関とかがウリ文句

        親コメント
      • by Anonymous Coward on 2018年05月09日 17時36分 (#3405350)

        信頼ってーか、機関ごとに調べる遺伝子が違う、みたいなケースを考えれば良い。

        Aが発現してると胃癌確率が20%増で、1500円で調べられて、
        Bが発現してると胃と腸の癌が15%増で、2000円で調べられて、
        Cが発現してると食道から胃にかけての癌が10%増で、3000円で調べられる、
        という時にBとCが発現してる人が検査を頼む。

        Aだけ調べる機関に頼むと1500円で「あんた大丈夫だよ」と言われ、
        AとBだけ調べる機関に頼むと3500円で「あんた15%増だよ」と言われ、
        AとCを調べる機関に頼むと4500円で「あんた10%増だよ」と言われる。

        どれも検査結果という意味では誠実に予測を述べている形だが、全部調べていれば(6500円で)25%増という結果が出るはず、というものに対しては不正解。
        (あくまで簡易モデルなので単純な足し算になるわけないだろうが)

        遺伝子と発病確率の関係についてすらカッチリ分かってるわけでもない現状でどこまで金かねかけてどこまで信じるか、非常に難しい問題。
        (その上で「やったよ」と言いつつ特定遺伝子をちゃんと検出してないバカ検査やってるって可能性ももちろんあるのだが)

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    • by Anonymous Coward

      ORIG3N社の「SUPERHERO」という遺伝子検査キットって、だいたいそんな感じの「素質ありますよ!」って返す奴なんじゃねぇの?

    • by Anonymous Coward

      うん。一見センセーショナルに見える結果を引き出せるイタズラだけど、あんまり意味はない。

      どんなにあり得ないと思われる入力でも、顧客が良い感じと思ってくれる結果を出力すべし、なんてのは無駄な仕様の押しつけでしかない。
      変なものが混ざってるかもしれない対象を検査をしたいというなら、その分のコストを掛けて割高な値段をふっかけてやれば良い。

      #3405306 [srad.jp]が言及しているような「複数の業者に出すと、みんなバラバラの結果になる」とかなら信頼性に疑義という事になるけど。

      • by Anonymous Coward

        この記事でも複数の業者に出して「一社だけ”結果”送り返してきた」から、少なくともこの業者に関しての信頼性に疑義はある。

        • by Anonymous Coward on 2018年05月09日 17時13分 (#3405342)

          そこいらの人間より運動能力が優れているラブラドール・レトリバーの遺伝的な才能を言い当てているのだから、ちゃんと仕事はしている。犬か人間かの鑑定を頼んだ訳ではないのだし、コストを優先するために、いたずら対策のチェックなどしないというなら、それはそれで会社のポリシーとして間違ってはいない。

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          • by Anonymous Coward

            種の判定についてはレポートのフォーマットにないだけで実は判定できているからこその結果内容なのかもしれないし。

            • by Anonymous Coward

              犬だと知っていてレポートを書いている可能性も捨てがたいけれど、チワワなのかラブラドール・レトリバーなのかも調べてから書かないと恥をかくことになる。

              • by minet (45149) on 2018年05月09日 21時59分 (#3405488) 日記

                俺なら、犬だと分かって書くなら、『嗅覚に優れています』とか、『肉食系です』とか、犬種もわかれば『モフモフします』とか、「明らかに犬だとわかっているのに犬と書かない」感じのレポートを出して依頼者のイタズラに付き合ってあげるかなぁ。

                親コメント
          • by Anonymous Coward

            そういうものを決定する因子って犬と人間で共通なのか?DNAに関係なく適当なこと書いてるだけのような気がするんだが。

            • by Anonymous Coward

              この辺、何を見ているかで全然変わってきますね。
              「ヒトの中で運動能力が高いヒトの8割がこの配列を持ってる」みたいな関連性があいまいな判定やってるとすると、ヒトと犬とで全然違ってもおかしくない。
              「この配列を持ってる哺乳類はより筋肉質になる酵素が優位に生産される」みたいな仕組みが分かっているのであれば、ヒトと犬とで同じ判定が出るのも有りかもしれない。
              (牛とかが超筋肉質になる遺伝子、とかあったはず)

    • by Anonymous Coward

      いたずら対して、真面目に対応されたと、文句を言っている餓鬼みたい。
      もっと間抜な結果を期待していたんだろうが、業者が出鱈目か否かをチェックする実験としてはもう一つだよね。

  • by nemui4 (20313) on 2018年05月09日 16時43分 (#3405314) 日記

    検便で自分のンコを採取できなくて、道端の犬のンコを採取して提出したら再検査になったとかいう都市伝説を思い出した。

    • by tenokida (42811) on 2018年05月09日 16時58分 (#3405333) 日記

      「動物のお医者さん」ネタが出てこないってのがもう古いってことか

      漆原教授が指摘するまで獣医科の人間もわからない
      まあ認知のスコープが違うと詳しいほどスコープ側をいじれずにはまる

      親コメント
      • by Anonymous Coward

        それは清原が平九郎の血液を自分のと偽って健康診断に出そうとして、
        二階堂のと入れ替わってしまったエピソードですね。

        犬のうんこを自分のの代わりに検便に出そうとしたのはハムテルだったかと

        • >清原が平九郎の血液を
          >二階堂のと入れ替わって

          はじめ獣医学部側は驚愕のあまり誰のサンプルか確認をすっとばして
          「菱沼聖子?」と決めてかかっていた。

          >犬のうんこ

          それはH大に進学するよりずっと前の昔の話(小学校時だったか)
          // あのマッチ箱は昔も今も形状が一緒。

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    • by Anonymous Coward

      漫画「あさりちゃん」だったかな、そのエピソードがあったような。

    • by Anonymous Coward

      尿検査の際に、午後の紅茶レモンティーを容器に入れて提出した人がいたという話を聞いたことがあります。

    • by Anonymous Coward

      筒井康隆が、「狂気の沙汰も金次第」という夕刊フジのエッセー集にそんなことを書いていた。
      もっとも舌で身繕いする犬の糞には犬の体毛が未消化のまま一杯含まれてるからすぐ見分けが付く、と中学時代、理科教師に聞いた覚えがある。

  • by Anonymous Coward on 2018年05月09日 16時33分 (#3405303)

    イヌの御用達のところかもしれないじゃないか。

    • by Anonymous Coward

      イヌとして判定して「自転車のような競技に向いてる」とするのはいくらなんでもおかしいだろと思ったが、
      「自転車に乗る犬」で検索したら、結構いるみたいで驚いた。

  • by Anonymous Coward on 2018年05月09日 19時14分 (#3405401)

    DNAのATGCは地球上の全生物で共通じゃないの?
    #だからこそ、大腸菌にヒトのインシュリン作らせたりできるんだもの。

    日本人に日本語と偽って中国の漢字で書かれた文章を渡しても一目で見破るけど、
    日本人にインドの地方公用語を、オリヤー語なのをコンカニ語(てきとう)と言って
    渡しても見抜けませんでしたみたいな。

    或いは日本語も英語も知らない人に、ローマ字で書かれた日本語の文章を英語と偽って渡しても
    見抜けなかったみたいな。

    おかしいとは思うかもしれないが、集計アプリで統計的な調査をするだけなら、
    そりゃそういうことも起きるだろうさ。

    • by Anonymous Coward on 2018年05月09日 22時38分 (#3405503)

      この検査で見ているのは遺伝子型なので、何番染色体の何番目の遺伝子の何個目の塩基の違いとかを見るはず。
      即ち生物種によって染色体の数が異なる(ヒト23対、イヌ39対)のを直ぐに調べられるはずなのに、いきなり特定の塩基配列に反応する検査キットにブチ込んだり、DNAシーケンサーから出たDNA断片をリファレンスと比較して「多分筋肉に関わる何番遺伝子のXX型じゃね?」みたいな診断内容を出すいい加減なサービスなんじゃないか?というのがこの記事の指摘。
      最低限、診断結果が客観的に見て妥当性がある = 別の診断機関に依頼しても(検出能力はさておき)同じ判断がなされるようでなければ、お金を払うようなプロの検査品質ではないと言われても仕方ないんじゃないでしょうか。

      # 「筋力に優れていて...という診断は検査員個人の見解です」なんて診断は嫌すぎる。

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      • by Anonymous Coward

        むしろ犬だからばれなかった可能性も・・・

        これが猫だったら、「あれ?染色体が足りないぞ?」ですぐバレていたかもね

        # 多い分には問題なし(オイ

        • by Anonymous Coward

          いや
          猫耳少女はいたんだ!
          って騒ぎになる

          #少女とは限りません

    • by Anonymous Coward on 2018年05月09日 21時55分 (#3405486)

      かなり胡散臭いです。

      ORIG3N社の「SUPERHERO」の解説を見てもどのように解析しているのかわかりませんが、現代的には次世代シークエンサーを利用していると思われます。次世代シークエンサーでは100~1000塩基くらいのDNA配列が数億行出力され、各DNA配列がヒトゲノム配列のどこに合致しているか解析します。そして、筋力や寿命に関連することが知られている塩基多型があるかどうかで判断します。

      イヌのDNA配列はヒトゲノム配列にほとんど合致しないので、親切な会社であれば何か間違っていないか、さらに技術力がある会社であればイヌのDNA配列ではないか、と報告してくれるはずです。

      この場合、ひどいと次世代シークエンサーさえかけずに適当言っているだけの可能性もあります。

      親コメント
      • by Anonymous Coward

        検査キットが30ドルだし、NGSは使わずに専用パネルで発現見てるだけじゃないかなぁ?

    • by Anonymous Coward

      その例えで言うなら、
      『すぐれた英文かどうかを判定するサービスにスペイン語の文章を送りつけてみたら、スペイン語かどうかは見破られずになんかそれっぽい結果だけが返ってきた』
      ってとこでしょう。

      集計アプリで統計的な調査をするだけなら、
      そりゃそういうことも起きるだろうさ。

      まぁそういうことなんだろうけど。

    • by Anonymous Coward

      まぁ、同じ哺乳類だからな
      たいていの遺伝子は犬にもあって、人間固有というのはそんなに多くないでしょ

  • by Anonymous Coward on 2018年05月10日 11時00分 (#3405662)

    この検査キットだと30ドル程度でできるのね
    何万もするサービスなら批判する気持ちもわかるけど、この価格なら特に驚かないなぁ

  • by Anonymous Coward on 2018年05月10日 12時46分 (#3405700)

    実はターゲットは犬に化けた人間だったのだ

  • by Anonymous Coward on 2018年05月14日 18時47分 (#3407973)

    そのむかし検便に犬の糞をつめたら
    おたくは子供に何を食べさせてるのっ!、と云われたというのは誰だっけ?

    筒井康隆? 赤塚不二夫?

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